Le Musée national d’histoire naturelle, situé dans un palais du XVIIIe siècle au cœur de la ville fortifiée de Mdina, détient près d’un million de spécimens dans ses collections. Parmi ses trésors, un calmar volant échoué dans les années 1980, un crocodile du Nil momifié vieux de 4000 ans, le crâne d’une fausse orque Pseudorca crassidens, la tête fossilisée d’un crocodilien Tomistoma gaudense trouvée dans les rochers de Gozo, et la dent du requin blanc géant Charcarocles megalodon. Le musée présente également une salle consacrée aux oiseaux, illustrant la biodiversité de la région.
Le palais a été édifié dans le style baroque parisien par le Grand Maître Antonio Manoel de Vilhena en 1724, et il a joué divers rôles au cours de son histoire, notamment comme hôpital temporaire durant l’épidémie de choléra de 1837, sanatorium pour les troupes britanniques en 1860, et hôpital pour patients tuberculeux jusqu’en janvier 1956. Le 22 juin 1973, le musée a été officiellement inauguré et ouvert au public avec pour mission l’acquisition, la collecte, l’exposition et la conservation des spécimens d’histoire naturelle, en mettant l’accent sur la flore et la faune locales.
Les expositions abordent divers thèmes comme la biodiversité et l’écologie locales, la géologie et la paléontologie, la minéralogie, l’évolution humaine, la faune marine, les structures squelettiques, les insectes, les coquillages et les oiseaux. Des salles sont consacrées aux historiens de la nature locaux ayant contribué à l’enrichissement des connaissances sur la flore et la faune de la région. Une salle honorant Joe Sultana se concentre sur l’importance écologique des îles de Filfla, Fungus Rock, St. Paul’s et Comino. La salle Habitats, dédiée au premier conservateur de l’histoire naturelle, Giuseppe Despott, offre une vue d’ensemble des habitats maltais typiques tels que les bois, la garrigue, les falaises, les vallées et les rivages sablonneux, mettant en lumière la diversité des oiseaux et de nombreuses espèces fauniques. Le L. Mizzi Hall, contenant environ 850 pièces de roches et de minéraux ainsi que plusieurs œuvres d’art, présente une partie de la collection de minéraux de Lewis Mizzi.
